Um was für Scripte handelt es sich denn? JS, VBS, AppleScript?
Versuch sie per Doppelklick im Explorer einach mal zu starten. Besitze zwar InDesign nicht, dürfte aber theoretisch ähnlich sein wie in PS.
Kopiere sie mal in den Ordner ..\Vorgaben\Scripte\. In PS sind sie dann unter "Datei-->...