Die Ai-Datei bleibt auch „leer“, weil du lediglich ein Muster bearbeitet hast. Der einzige Unterschied zu vorher dürfte bei den Farbfeldern zu sehen sein, in denen die Muster abgelegt bzw. angezeigt werden und auch dein neues evtl. enthalten sein sollte. Um dein Muster in der Ai-Datei zu „sehen“, müsstest du ein Objekt auf die Arbeitfläche zeichnen und dies mit deinem Muster füllen.

https://helpx.adobe.com/de/illustrator/using/patterns.html