Das ist so pauschal nicht korrekt. Zum Verständnis (oder Unverständnis): Es gibt verschiedene PDF-Versionen. Bei PDFs bis Version 1.3 findet immer eine Reduzierung der Transparenzen statt. Ob es hierbei zu fehlerhaften Darstellungen kommt, kann man nicht vorhersagen. Ab PDF Version 1.4 ist es möglich, Transparenzen im PDF zu erhalten. Das wird dir wahrscheinlich für deinen Drucker zu Hause herzlich wenig bringen, da hier durch die interne Verarbeitung trotzdem geflattet wird. Für die Druckerei könnte es von Vorteil sein. ABER: Du müsstest im Vorfeld abklären, ob der Laden fähig ist, ein PDF/X-4 korrekt zu verarbeiten. Dafür müssen nämlich bestimmte technische Voraussetzungen gegeben sein, z.B. die Verwendung der Adobe Pdf Print Engine (APPE).
Insgesamt ein recht kompliziertes Thema, zu dem aber schon massenweise geschrieben wurde. Ich darf auch dir das empfehlen, in dem auch dieses Thema in verständlicher Form behandelt wird.
Wenn die Datei nicht flexibel bleiben muss, d.h. nicht ständig geändert wird, wäre das eine Möglichkeit.