Das Boole Objekt versagt.
Welche C4D Version? Bitte im Profil eintragen, das erscheint dann links, danke.
Der Boole in C4D ist nicht grundsätzlich schlecht, und ja, bei komplexen Objekten kann das schwierig sein. Ich würde da vermutlich erst nochmals schauen, wieweit das Modell und auch die Boole-Objekte (die kannst Du ja während der Animation auch austauschen an Stellen, wo es *definitiv* nicht möglich ist, die Geometrie exakt auf den Boole anzupassen) nicht doch auf die Animation in der Geo anzupassen sind. Es muss z.B. nicht ein einzelnes Boole-Objekt sein, wenn sich herausstellt, dass zu viel Geo auf einmal an der gleichen Stelle das Boolen crasht.
Womit renderst Du denn? Mehr Infos, mehr Lösungen
Transparenzen haben eine andere Wirkung. Du kannst natürlich einen (C4D-)Verlaufsshader in eine Alphamap packen und die dann z.B. seitlich drauflegen und den Verlauf animieren. Je nach Renderer ist das mehr oder weniger "Ressourcen schonend", was immer damit gemeint ist.
Wenn Du als Ressource z.B. sehr günstig bist, wäre eine Möglichkeit, sich das Aufbauen "an sich" mal anzuschauen und mit PLA und Skalieren von Objekten/Teilen zu überlegen. Auch wenn das Modell "sehr komplex" ist, heißt das ja nicht, dass das keine Lösung wäre. Ein Screenshot wäre da auch hilfreich.